隨著小分子藥物、生物制品以及新型治療手段的快速發(fā)展,藥物在體內(nèi)的代謝過程日趨復(fù)雜。在藥物研發(fā)的非臨床階段,系統(tǒng)鑒定體內(nèi)外代謝產(chǎn)物是預(yù)測人體暴露風(fēng)險、指導(dǎo)毒理種屬選擇及優(yōu)化臨床試驗設(shè)計的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。
根據(jù)ICH M3(R2)指導(dǎo)原則,若人體循環(huán)中某一代謝物的暴露量超過母體藥物總相關(guān)物質(zhì)AUC的10%(即MIST閾值),且其在人體中的暴露量水平顯著高于毒理學(xué)試驗動物中的最大暴露量,則表明所用動物種屬未能充分覆蓋該人體代謝物,此時需針對該代謝物另行開展非臨床安全性評價。美國FDA 2020年發(fā)布的《Safety Testing of Drug Metabolites》指導(dǎo)原則進一步強調(diào),應(yīng)通過體外跨種屬比較驗證毒理種屬對關(guān)鍵代謝物的覆蓋能力。我國NMPA在《藥物代謝產(chǎn)物安全性試驗技術(shù)指導(dǎo)原則》中要求盡早進行代謝差異比較與分析,以決定是否開展安全性評價。為了更全面地理解藥物的代謝行為,通常需綜合運用多種實驗體系,對體內(nèi)外代謝產(chǎn)物進行定性與半定量分析。下文將系統(tǒng)介紹常用體外與體內(nèi)代謝實驗體系的特點及應(yīng)用策略。
體外代謝實驗體系是模擬藥物體內(nèi)生物轉(zhuǎn)化過程的重要工具,可用于識別主要代謝產(chǎn)物及其代謝途徑。體系選擇需綜合考慮研究目的、藥物特性(如分子類型、理化性質(zhì))及目標(biāo)代謝通路的覆蓋范圍。下文總結(jié)了常用體外代謝體系(按復(fù)雜性遞增:從簡單、機制明確到復(fù)雜、生理相關(guān))及其特點與應(yīng)用策略。目的:明確特定代謝酶(如單個CYP450亞型、UGT、SULT等)對化合物的代謝作用。特點:表達(dá)單一特定的代謝酶(如CYP3A4、UGT1A1),體系純凈,背景干擾低,易于生成單一、純凈的代謝物。局限性:酶活性水平遠(yuǎn)高于生理濃度,缺乏體內(nèi)復(fù)雜的酶協(xié)同或競爭作用,結(jié)果外推至體內(nèi)需謹(jǐn)慎。
- 鑒定特定酶(如某個CYP或UGT亞型)介導(dǎo)的代謝途徑;
- 作為其他體系(如微粒體、肝細(xì)胞)代謝途徑研究的靶向驗證工具。
目的:評估化合物在對應(yīng)器官微粒體中的I相代謝穩(wěn)定性、代謝產(chǎn)物譜及主要參與代謝的CYP亞型等。特點:富含I相代謝酶(如細(xì)胞色素P450酶系)和部分II相代謝酶(如尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶,UGT),應(yīng)用廣泛、標(biāo)準(zhǔn)化程度高、酶含量高、操作簡便和成本較低,適用于高通量篩選。局限性:缺乏完整細(xì)胞結(jié)構(gòu),II相代謝酶含量較低(除UGT外),無法模擬藥物的完整攝取、轉(zhuǎn)運及分泌過程,可能低估結(jié)合型代謝物(如硫酸酯、谷胱甘肽結(jié)合物)的生成。
- 通常在單體酶確認(rèn)關(guān)鍵酶后,用于研究其在更接近生理的酶混合物環(huán)境中的代謝行為;
- 作為I相代謝(尤其是CYP450介導(dǎo))研究的黃金標(biāo)準(zhǔn)和核心工具;
- 結(jié)合反應(yīng)(如葡萄糖醛酸化)的初步評價;
- 除肝微粒體外,亦可使用肺、腸、腎等器官來源的微粒體開展器官特異性代謝研究。
目的:評估包含I相(CYP450等)和II相(UGT、SULT、GST等)代謝酶在內(nèi)的更全面代謝穩(wěn)定性與代謝產(chǎn)物譜。特點:包含完整的I相和II相代謝酶(包括胞漿酶),可同時發(fā)生氧化、還原、水解和結(jié)合反應(yīng),并可模擬溶酶體酸性環(huán)境,代謝潛力覆蓋更全面。局限性:酶濃度和活性通常低于微粒體或胞漿,背景雜質(zhì)較多,代謝速率較慢,難以大量生成代謝物。
- 當(dāng)懷疑有重要胞漿酶(如AO、XO、SULT、GST等)參與代謝或需同時考察I相和II相代謝時選用;
- 可快速獲得代謝物譜輪廓(尤其含II相結(jié)合產(chǎn)物);
- 作為多肽-藥物偶聯(lián)物(PDC)和核酸類藥物代謝研究的初篩補充體系,用于評估水解酶介導(dǎo)的降解或酸性環(huán)境穩(wěn)定性,但需結(jié)合更生理相關(guān)的體系(如原代細(xì)胞、胞漿)進行關(guān)鍵機制驗證。
目的:評估化合物是否被特定胞漿酶代謝(如硫酸化、谷胱甘肽結(jié)合),研究相應(yīng)酶動力學(xué)。特點:主要含有可溶性II相代謝酶(如谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶,GST;N-乙酰基轉(zhuǎn)移酶,NAT;硫酸基轉(zhuǎn)移酶,SULT;醛酮還原酶,AKR),無膜結(jié)構(gòu)干擾,酶活性位點直接暴露。局限性:完全缺乏I相代謝酶,僅覆蓋特定II相代謝途徑(如谷胱甘肽結(jié)合、硫酸化、乙酰化),代謝途徑單一,應(yīng)用場景受限。
- 專門研究特定II相代謝途徑(如SULT、GST等)或需可溶性輔因子的酶(如ALDH);
- 生成特定II相代謝物標(biāo)準(zhǔn)品;補充微粒體或S9體系的研究結(jié)果。
目的:模擬藥物在完整、有活力細(xì)胞內(nèi)的整體代謝處置過程。特點:原代細(xì)胞(如原代肝細(xì)胞)保留完整的細(xì)胞結(jié)構(gòu),含豐富的I相和II相酶(如CYP、UGT、AO、FMO、SULT、GST等),具有最高的生理相關(guān)性。局限性:制備復(fù)雜,成本高昂,細(xì)胞活性隨時間下降較快。
- 引入了細(xì)胞完整性、轉(zhuǎn)運體、內(nèi)源性輔因子、酶的空間分布等更接近體內(nèi)環(huán)境的因素,是評估藥物整體代謝命運(攝取、代謝、外排)的金標(biāo)準(zhǔn)體系;
- 通常在亞細(xì)胞組分(微粒體/S9)篩選后,用于評估更綜合的代謝行為。
目的:通常用于研究化合物在組織(如腸、腎、肺、腦、皮膚)的代謝穩(wěn)定性與代謝產(chǎn)物譜,識別潛在的組織特異性毒性或活化。特點:保留了所有細(xì)胞器及酶系(包括I相和II相酶),最接近體內(nèi)的生理環(huán)境。局限性:背景干擾較大(含細(xì)胞碎片、內(nèi)源性物質(zhì)多),對分析技術(shù)要求較高,酶活性可能不如純化體系穩(wěn)定。
- 當(dāng)關(guān)注化合物在特定靶器官或首過代謝器官(如腸道)的局部代謝時使用;
- 核酸類藥物(如短干擾核糖核酸、小干擾RNA (siRNA)、反義寡核苷酸 (ASO)等)代謝研究常用體系(如肝、腎勻漿)。
腫瘤組織勻漿(Tumor Homogenates)目的:評估抗腫瘤藥物在目標(biāo)腫瘤組織中的代謝穩(wěn)定性(是否被腫瘤細(xì)胞快速滅活)或研究前藥在腫瘤組織中的活化特性(如通過腫瘤特異性酶的作用)。此外,研究腫瘤微環(huán)境(如酸性環(huán)境)對藥物代謝行為的影響。特點:直接針對靶組織,可能揭示腫瘤特異的代謝途徑(如某些腫瘤高表達(dá)的酶)。局限性:樣本獲取困難(通常來自手術(shù)或活檢)、個體差異大(腫瘤異質(zhì)性)、制備和標(biāo)準(zhǔn)化困難(勻漿程度、酶活性保持)。
- 識別和鑒定僅在腫瘤組織勻漿中出現(xiàn)或在腫瘤組織中顯著增強的代謝產(chǎn)物,從而發(fā)現(xiàn)潛在的腫瘤特異性代謝酶或通路;
- 驗證前藥是否能夠成功實現(xiàn)靶向活化策略的關(guān)鍵實驗。
血漿/全血(Plasma/Whole Blood)目的:評估化合物在血漿/全血中是否被酶解(如酯酶、肽酶)。特點:專門用于評估血漿/全血中水解酶(如酯酶CES、肽酶)介導(dǎo)的代謝行為。它能夠反映化合物在血漿/全血中的特異性失活途徑,操作簡單,并且無需添加輔酶因子。局限性:僅適用于評估水解代謝途徑,種屬差異顯著。例如,酯酶活性在動物與人類之間存在極大差異,因此臨床預(yù)測必須使用人源血漿/全血,而動物血漿僅適用于輔助機制研究。
- 驗證前藥的活化或穩(wěn)定性優(yōu)化,探索藥物在血漿中的活化與失活機理;
- 化合物在血液/血漿中的穩(wěn)定性研究及代謝產(chǎn)物快速篩選;
- 評估ADC、多肽類或寡核苷酸類藥物的降解風(fēng)險;
- 分析低生物利用度是否由血漿降解因素導(dǎo)致。
下表總結(jié)了不同分子類型推薦的體外代謝實驗體系、應(yīng)用策略及關(guān)鍵注意事項:
在早期研發(fā)階段,多采用上述體外體系進行跨物種代謝物譜對照,確認(rèn)所選物種可覆蓋人體代謝物。若發(fā)現(xiàn)動物中無或低量存在人特異性代謝物,則需重點關(guān)注該代謝物的毒性風(fēng)險。
在毒理學(xué)或藥代動力學(xué)研究過程中,收集血漿、尿液、糞便等樣本,通過LC-UV-HRMS等方法分析藥物及其代謝物譜。常用嚙齒類(小鼠、大鼠)和非嚙齒類(犬、靈長類)動物進行研究,通過不同物種的體內(nèi)代謝譜對比,可以初步判斷所選物種是否覆蓋人體代謝特征。
根據(jù)藥物研發(fā)的不同階段,應(yīng)合理組合使用上述實驗體系:
主要使用肝微粒體和懸浮肝細(xì)胞等體外體系快速評估候選化合物的代謝途徑。在此階段,常跨物種使用人、鼠、犬、猴的肝微粒體或肝細(xì)胞,篩選體外代謝產(chǎn)物并比較譜圖,初步識別代謝軟點,指導(dǎo)化合物結(jié)構(gòu)優(yōu)化。若早期發(fā)現(xiàn)化合物代謝率慢或存在特殊代謝途徑,可使用更完善的體外體系進行深度分析。例如,對于慢速代謝物,可采用貼壁培養(yǎng)的肝細(xì)胞或懸浮肝細(xì)胞接力孵育法以延長孵育時間;對于產(chǎn)生反應(yīng)性代謝物的化合物,可在微粒體/S9體系中加入GSH/Cys等捕獲劑,評估化合物的潛在毒性風(fēng)險。此外,可借助重組CYP/UGT酶體系鑒定具體酶亞型的代謝產(chǎn)物和貢獻(xiàn)度。在毒理學(xué)的動物種屬選擇時,進行跨物種體外代謝物譜對比和有限的動物體內(nèi)代謝研究,確保所選擇的物種可覆蓋人體代謝情況。代謝實驗體系的選擇應(yīng)以化合物結(jié)構(gòu)、物理化學(xué)性質(zhì)和已知代謝途徑為依據(jù)。對于疏水性較大、膜透過性較好的化合物,可優(yōu)先使用懸浮肝細(xì)胞測試;若預(yù)測主要通過CYP酶代謝,則首選肝微粒體;針對已知主要代謝酶,可使用重組酶進一步驗證其代謝產(chǎn)物結(jié)構(gòu)。合理的實驗設(shè)計通常采取“由單一體系到多體系、先體外后體內(nèi)”的遞進式策略,以覆蓋盡可能多的代謝產(chǎn)物。不同物種之間的代謝酶譜存在顯著差異,導(dǎo)致代謝物譜在定性和定量上可能存在較大差異。例如,某些CYP亞型在人類、犬和鼠中的表達(dá)量不同,使得人特異代謝物僅在部分動物中出現(xiàn)(華法林在人體中由CYP2C9介導(dǎo)生成毒性代謝產(chǎn)物7-羥基華法林,在大鼠代謝研究中可檢測出該毒性代謝產(chǎn)物,而犬幾乎不產(chǎn)生7-羥基華法林)。因此,在選擇相關(guān)動物種屬時需充分考慮物種差異,通常建議在體外研究階段,采用人源及多種動物來源的肝細(xì)胞(或肝微粒體)進行平行評價,以提高體外至體內(nèi)外推的可靠性及毒理評估的物種相關(guān)性。根據(jù)FDA-MIST指導(dǎo)原則,當(dāng)人體血漿中發(fā)現(xiàn)高比例代謝物(>10%母體AUC)時,需與毒理動物的代謝物暴露進行對比。如果動物中缺少或暴露顯著低于人體的代謝物,則應(yīng)在該動物或其他替代物種中進行額外的代謝物安全性研究。國家藥監(jiān)局(NMPA)也鼓勵盡早開展人體放射性物質(zhì)平衡研究,以全面了解藥物的代謝和排泄特征。2024年發(fā)布的技術(shù)指導(dǎo)原則明確指出,通過人體物質(zhì)平衡研究可鑒定藥物在體循環(huán)中的代謝產(chǎn)物并測定其占比,為后續(xù)研發(fā)工作提供依據(jù)。因此,在開展非臨床研究時應(yīng)緊密結(jié)合全球法規(guī)要求,在合適的時間節(jié)點使用相應(yīng)體系獲得代謝物數(shù)據(jù),以確保安全性評估的充分性。
非臨床階段藥物代謝產(chǎn)物研究需要綜合利用多種實驗體系,系統(tǒng)刻畫候選藥物的代謝命運。從體外肝微粒體、肝細(xì)胞、S9和重組酶體系到常規(guī)動物體內(nèi)代謝研究,各體系各有側(cè)重,應(yīng)根據(jù)藥物特性和開發(fā)階段合理組合使用。通過體外預(yù)測結(jié)合體內(nèi)驗證,實現(xiàn)代謝物的全譜分析和安全性評估,從而滿足藥物開發(fā)和監(jiān)管申報的需求。
在實際研究中,建議制定前瞻性的代謝研究策略,靈活調(diào)整實驗方案,確保關(guān)鍵代謝物在安全性研究物種和人體中得到充分覆蓋。有濟醫(yī)藥DMPK部門已建立完善的代謝產(chǎn)物研究平臺,使用LC-UV-HRMS(Q-Exactive或Q-TOF)高分辨液質(zhì)聯(lián)用儀,在體內(nèi)/外生物樣品中捕獲未知代謝物信號響應(yīng),結(jié)合專業(yè)數(shù)據(jù)分析解析軟件,快速完成結(jié)構(gòu)推測。同時,我們還搭建了放射性同位素技術(shù)平臺,可承接3H、14C 、125I、99mTc 等放射核素標(biāo)記物的非臨床與臨床相關(guān)研究,開展質(zhì)量平衡、物質(zhì)排泄途徑及代謝產(chǎn)物譜的定量與定性研究,全面揭示藥物在生物體內(nèi)的代謝命運。兩大技術(shù)平臺相互支撐,共同為藥物研發(fā)提供全面、可靠的代謝信息支持。