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有濟(jì)說 | 寡核苷酸藥物的體外代謝研究策略與方法全解析

近年來,寡核苷酸藥物作為一種新型治療手段發(fā)展迅速,在罕見病、心血管疾病、自身免疫性疾病及代謝性疾病領(lǐng)域展現(xiàn)出廣闊的治療前景。隨著研究的深入,監(jiān)管機(jī)構(gòu)已針對(duì)寡核苷酸藥物的非臨床安全性評(píng)價(jià)及臨床藥理研究發(fā)布了相關(guān)指導(dǎo)原則[1]-[2],但目前尚無專門針對(duì)其非臨床藥代動(dòng)力學(xué)(DMPK)研究的相關(guān)指南。因此,如何設(shè)計(jì)并開展支持新藥申報(bào)(IND/NDA)的體外代謝研究,仍是研發(fā)人員關(guān)注的重點(diǎn)。


對(duì)于寡核苷酸藥物,其在體內(nèi)循環(huán)系統(tǒng)及靶組織中的穩(wěn)定性及暴露形式是影響其安全性和有效性的關(guān)鍵因素,需通過體內(nèi)外代謝研究提供數(shù)據(jù)支持。本文針對(duì)寡核苷酸藥物的特性、作用機(jī)制及已上市產(chǎn)品的研究經(jīng)驗(yàn),系統(tǒng)探討其體外代謝研究的策略和方法。






一、寡核苷酸藥物的特性及作用機(jī)制


寡核苷酸藥物是由人工化學(xué)合成的12~30個(gè)核苷酸的單鏈或雙鏈分子。與傳統(tǒng)小分子和抗體藥物不同,其通過堿基互補(bǔ)配對(duì)原理,特異性結(jié)合內(nèi)源性核酸序列,在mRNA水平上調(diào)控基因表達(dá),從而實(shí)現(xiàn)疾病治療[3]。主要類型包括小干擾RNA(siRNA)、反義寡核苷酸ASO)、微小RNA(miRNA)等。


此類藥物具有靶向特異性強(qiáng)、毒性較低、研發(fā)成功率較高等優(yōu)勢(shì),且可作用于傳統(tǒng)藥物難以靶向的治病基因。然而,其高極性、強(qiáng)負(fù)電荷及易被核酸酶降解等特性,顯著限制了成藥性。為此,通常需要采用化學(xué)修飾遞送系統(tǒng)進(jìn)行優(yōu)化。


常見的化學(xué)修飾包括:骨架修飾(如硫代磷酸酯,PS);糖環(huán)修飾(如2’-O-甲基、2’-氟、鎖核酸LNA);堿基修飾;末端修飾。


遞送系統(tǒng)方面,肝靶向技術(shù)最為成熟,主要包括脂質(zhì)納米顆粒(LNP)和N-乙酰半乳糖胺(GalNAc)偶聯(lián)技術(shù)。隨著遞送技術(shù)的研究深入,肝外靶向遞送技術(shù)成為熱點(diǎn),策略包括:配體偶聯(lián)(如膽固醇、長鏈脂肪酸等);抗體、多肽偶聯(lián);外泌體等新型載體。


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二、寡核苷酸藥物的體外代謝研究


寡核苷酸藥物主要經(jīng)血漿和組織中廣泛存在的核酸內(nèi)切酶和核酸外切酶代謝,而非依賴肝臟的Ⅰ相和Ⅱ相代謝酶[3]-[4]。若采用特殊遞送系統(tǒng)(如LNP、脂肪酸偶聯(lián)物),其載體部分可能經(jīng)肝臟的Ⅰ相和Ⅱ相代謝酶代謝,需予以考慮。其中,核酸外切酶從鏈末端逐個(gè)切除核苷酸,而核酸內(nèi)切酶在鏈內(nèi)部切割,產(chǎn)生不同長度的片段。


體外代謝研究在寡核苷酸藥物開發(fā)中具有三大核心價(jià)值:


  • 篩選出穩(wěn)定性高、半衰期長的候選分子;

  • 確定體內(nèi)主要暴露形式(原形、代謝物);

  • 評(píng)估藥物在循環(huán)系統(tǒng)及靶組織中的穩(wěn)定性,預(yù)測(cè)生物利用度及藥效。


需注意,與化學(xué)小分子藥物不同,寡核苷酸藥物的代謝研究一般不用于種屬選擇,因其非臨床動(dòng)物種屬主要依據(jù)靶序列同源性確定。


常用體外代謝體系如下表所示:


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三、寡核苷酸藥物體外代謝研究策略與應(yīng)用案例



當(dāng)前已上市的寡核苷酸藥物多以肝臟為靶點(diǎn),且肝臟是最重要的代謝器官,故代謝研究常聚焦肝相關(guān)基質(zhì)(肝勻漿、肝S9)及血漿。隨著肝外靶向藥物的發(fā)展,基于藥物的作用部位、給藥途徑等合理選擇代謝基質(zhì),如CNS藥物通常擴(kuò)展至腦組織勻漿、腦脊液等基質(zhì)。本文主要探討基于肝組織(肝勻漿、肝S9)及血漿的體外代謝研究策略。

1.肝勻漿代謝研究

肝勻漿保留肝臟全部亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)及酶系,能最全面模擬肝內(nèi)代謝環(huán)境,適用于早期候選物篩選。孵育液的pH、勻漿液濃度是重點(diǎn)考察條件。本研究優(yōu)化孵育條件為pH5.0、1:9 (g: mL)勻漿比例,考察陽性藥Inclisiran在食蟹猴和人肝勻漿中的代謝。結(jié)果顯示,Inclisiran在肝勻漿體系37℃孵育24 h后,藥物發(fā)生明顯代謝消除,正義鏈(SS)的代謝速率高于反義鏈(AS),種屬間無顯著代謝差異(圖1)。

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圖1. Inclisiran在食蟹猴和人肝勻漿中的代謝穩(wěn)定性

2.肝S9代謝研究

肝S9包含胞質(zhì)和微粒體組分,操作簡便,易于獲取,常用于IND申報(bào)階段。與肝勻漿體系的建立類似,由于寡核苷酸藥物本身的代謝特性與小分子不同,肝S9的濃度、孵育體系pH值通常對(duì)試驗(yàn)結(jié)果產(chǎn)生影響。在pH5.0、2 mg/mL蛋白濃度下,37℃孵育24 h,陽性藥Inclisiran在食蟹猴和人肝S9中同樣呈現(xiàn)時(shí)間依賴性代謝消除,正義鏈(SS)的代謝速率高于反義鏈(AS)(圖2)。

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圖2. Inclisiran在食蟹猴和人肝S9中的代謝穩(wěn)定性

3.血漿代謝研究

與寡核苷酸穩(wěn)定性直接相關(guān)的核酸酶在血液中大量分布,血漿穩(wěn)定性考察對(duì)早期候選物篩選研究至關(guān)重要。由于EDTA可抑制核酸酶的活性,通常選用肝素鈉抗凝的血漿考察寡核苷酸藥物的穩(wěn)定性。對(duì)多種已上市的寡核苷酸藥物的測(cè)試表明,37℃孵育24 h后,其在人、猴、大鼠血漿中均保持較高穩(wěn)定性,種屬差異較小(圖3)。

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圖3. 不同寡核苷酸藥物在SD大鼠、食蟹猴和人血漿中的代謝穩(wěn)定性

結(jié)語

寡核苷酸藥物的天然結(jié)構(gòu)易被生物體系中的核酸酶快速降解,是導(dǎo)致其體內(nèi)半衰期短、生物利用度低的主要原因。因此,評(píng)估并優(yōu)化其代謝穩(wěn)定性是早期發(fā)現(xiàn)階段的核心任務(wù)。有濟(jì)醫(yī)藥已建立涵蓋血漿/血清、肝勻漿、肝S9、肝溶酶體、肝細(xì)胞、腎勻漿等多種體外研究模型,可為寡核苷酸候選化合物的篩選優(yōu)化及臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)提供全方位技術(shù)支持。


參考文獻(xiàn):
[1]FDA Guidance for Industry: Nonclinical Safety Assessment of Oligonucleotide-Based Therapeutics, November 2024.
[2]FDA Guidance for Industry: Clinical Pharmacology Considerations for the Developments of Oligonucleotide Therapeutics, June 2024
[3]Berman, C. L., Aldinger, M., Bauss. OSWG recommended approaches to the nonclinical pharmacokinetic (ADME) characterization of therapeutic oligonucleotides. Nucleic Acid Therapeutics. 2023, 33(5), 287–305.
[4]Migliorati, J. M., Liu, S., Liu, A. Absorption, distribution, metabolism, and excretion of FDA-approved antisense oligonucleotide drugs. Drug Metabolism and Disposition, 2022, 50 (7), 888–897.


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